Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Rab3bQ9CZT8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Rab3bQ9CZT8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Rab3bQ9CZT8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Rab3bQ9CZT8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Rab3bQ9CZT8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Rab3bQ9CZT8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rab3bQ9CZT8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Rab3bQ9CZT8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Rab3bQ9CZT8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rab3bQ9CZT8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rab3bQ9CZT8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Rab3bQ9CZT8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Rab3bQ9CZT8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Rab3bQ9CZT8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rab3bQ9CZT8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rab3bQ9CZT8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rab3bQ9CZT8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Rab3bQ9CZT8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Rab3bQ9CZT8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Rab3bQ9CZT8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rab3bQ9CZT8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rab3bQ9CZT8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rab3bQ9CZT8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rab3bQ9CZT8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Rab3bQ9CZT8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Rab3bQ9CZT8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Rab3bQ9CZT8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rab3bQ9CZT8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Rab3bQ9CZT8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rab3bQ9CZT8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rab3bQ9CZT8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rab3bQ9CZT8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rab3bQ9CZT8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Rab3bQ9CZT8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Rab3bQ9CZT8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rab3bQ9CZT8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rab3bQ9CZT8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rab3bQ9CZT8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rab3bQ9CZT8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Rab3bQ9CZT8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rab3bQ9CZT8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rab3bQ9CZT8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rab3bQ9CZT8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rab3bQ9CZT8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rab3bQ9CZT8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab3bQ9CZT8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab3bQ9CZT8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rab3bQ9CZT8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rab3bQ9CZT8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rab3bQ9CZT8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rab3bQ9CZT8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rab3bQ9CZT8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rab3bQ9CZT8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Rab3bQ9CZT8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rab3bQ9CZT8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rab3bQ9CZT8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rab3bQ9CZT8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Rab3bQ9CZT8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Rab3bQ9CZT8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rab3bQ9CZT8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rab3bQ9CZT8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rab3bQ9CZT8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Rab3bQ9CZT8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rab3bQ9CZT8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rab3bQ9CZT8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rab3bQ9CZT8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
Rab3bQ9CZT8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rab3bQ9CZT8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rab3bQ9CZT8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rab3bQ9CZT8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rab3bQ9CZT8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rab3bQ9CZT8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Rab3bQ9CZT8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Rab3bQ9CZT8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rab3bQ9CZT8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Rab3bQ9CZT8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Rab3bQ9CZT8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rab3bQ9CZT8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Rab3bQ9CZT8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Rab3bQ9CZT8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Rab3bQ9CZT8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Rab3bQ9CZT8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Rab3bQ9CZT8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Rab3bQ9CZT8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Rab3bQ9CZT8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Rab3bQ9CZT8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Rab3bQ9CZT8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Rab3bQ9CZT8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Rab3bQ9CZT8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Rab3bQ9CZT8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Rab3bQ9CZT8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Rab3bQ9CZT8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Rab3bQ9CZT8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Rab3bQ9CZT8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Rab3bQ9CZT8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Rab3bQ9CZT8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,7 ms