RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577009.1

TNK1-208, Transcript of tyrosine kinase non receptor 1, human

TSL 4

Gene TNK1, Length 463 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNK1-208	ENST00000577009	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009		Q56UQ5	140 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009		Q6ZWC4	215 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	BMI1	P35226	326 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009		K7EIM0	57 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	APOA1	P02647	267 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	RCVRN	P35243	200 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	MFAP2	P55001	183 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	UCP3	P55916	312 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	TXN2	Q99757	166 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	OR4A16	Q8NH70	328 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	SPRY2	O43597	315 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	TNFRSF9	Q07011	255 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	STPG3	Q8N7X2	389 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	NUPR2	A6NF83	97 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	ADM	P35318	185 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	MFAP4	P55083	255 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNK1-208	ENST00000577009	CXorf65	A6NEN9	183 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	CTSG	P08311	255 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	SMPX	Q9UHP9	88 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009		A0A0J9YWU9	116 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	ATG12	O94817	140 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	YIF1A	O95070	293 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	CD5	P06127	495 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009		I3L2K1	104 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	GNG7	O60262	68 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	RND3	P61587	244 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	NCS1	P62166	190 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	AP3S1	Q92572	193 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	RNF183	Q96D59	192 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	CHEK1	O14757	476 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	MT-CO2	P00403	227 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	TBP	P20226	339 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	NPBWR1	P48145	328 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	RORC	P51449	518 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	RNF2	Q99496	336 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	HPGDS	O60760	199 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TNK1-208	ENST00000577009	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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