RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF773Q6PK81 442 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 CBR4Q8N4T8 237 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 DERL3Q96Q80 235 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 HINT2Q9BX68 163 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 PECRQ9BY49 303 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 KCNK15Q9H427 330 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0A6YYD4 124 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 FCGR3AP08637 254 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 LIMS3P0CW19 117 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 LIMS4P0CW20 117 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 GCSHP23434 173 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP10-1P60331 282 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 HAMPP81172 84 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 RRN3P1Q2M238 152 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 K7EIM0 57 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 CDK1P06493 297 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 NPPCP23582 126 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TALDO1P37837 337 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ETV1P50549 477 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00315P59091 139 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ST3GAL4Q11206 333 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 DHRS2Q13268 280 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 MOB3AQ96BX8 217 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 MISP3Q96FF7 219 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TXN2Q99757 166 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 FCGR1AP12314 374 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 P2RY1P47900 373 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 LILRB2Q8N423 598 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 METTL26Q96S19 204 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 IRGMA1A4Y4 181 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 UPK2O00526 184 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 SCGB2A1O75556 95 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 CIB2O75838 187 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 OXTP01178 125 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV3-20P01619 116 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ATP5G1P05496 136 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 DEFB130BP0DP73 79 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 DEFB130AP0DP74 79 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 NQO2P16083 231 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ATP5G3P48201 142 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 FXYD7P58549 80 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R31P59538 309 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ERVK-16P61578 105 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 WT1-ASQ06250 92 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 DCANP1Q8TF63 244 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM56Q96MV1 263 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 LYRM9A8MSI8 78 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 H3BMM0 161 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 FGF2P09038 288 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 GADD45AP24522 165 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 RANBP1P43487 201 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 NPBWR1P48145 328 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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