RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533013.1

TENM4-208, Transcript of teneurin transmembrane protein 4, human

TSL 3

Gene TENM4, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TENM4-208	ENST00000533013	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	ENKUR	Q8TC29	256 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	CITED4	Q96RK1	184 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TP53RK	Q96S44	253 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	ENY2	Q9NPA8	101 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	CDS2	O95674	445 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TRBV12-3	P01733	135 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	OR9G9	P0C7N8	305 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	ASAH1	Q13510	395 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	COA4	Q9NYJ1	87 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	THYN1	Q9P016	225 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	CCR6	P51684	374 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	C4orf46	Q504U0	113 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SEC22A	Q96IW7	307 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	C15orf61	A6NNL5	157 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TCRB	P04435	133 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	DEFA4	P12838	97 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	LYL1	P12980	280 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SYNJ2BP	P57105	145 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SP6	Q3SY56	376 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	USMG5	Q96IX5	58 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013		A0A0B4J2A0	478 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SFT2D2	O95562	160 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	IFNA21	P01568	189 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	IFNA17	P01571	189 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	CSN3	P07498	182 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	APELA	P0DMC3	54 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TMEM187	Q14656	261 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SLC35G3	Q8N808	338 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	HINT2	Q9BX68	163 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TENM4-208	ENST00000533013	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	PLA2G10	O15496	165 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	OR4E1	P0C645	316 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	PLET1	Q6UQ28	207 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	LYG2	Q86SG7	212 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	TMEM230	Q96A57	120 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	PALMD	Q9NP74	551 aa		12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	LCE6A	A0A183	80 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	OR2B8P	P59922	312 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	PPP1R1A	Q13522	171 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	HAGH	Q16775	308 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	LCN12	Q6JVE5	192 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	LRTM2	Q8N967	370 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	NUDT15	Q9NV35	164 aa		12.38	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013		A0A1B0GU03	582 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	C9orf170	A2RU37	121 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	BMPR1B	O00238	502 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	PRAF2	O60831	178 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	MED6	O75586	246 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	IGKV1-39	P01597	117 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TENM4-208	ENST00000533013	PRH1	P02810	166 aa		12.37	□□□□□ -0.43

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