RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.21□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.21□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RPEQ96AT9 228 aa3.21□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.21□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 WNK2Q9Y3S1 2297 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PLXNB1O43157 2135 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS46E5RG02 174 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CYB5BO43169 146 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PAX6P26367 422 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 G0S2P27469 103 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 DLK1P80370 383 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 KHDC3LQ587J8 217 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MIC13Q5XKP0 118 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf86Q6ZUL3 223 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N7P7 452 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5B3Q8NH48 314 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFRSF14Q92956 283 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB24Q969Q5 203 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 GGACTQ9BVM4 153 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PPV4 95 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MPDU1O75352 247 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV2-23P01705 113 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 BCL2P10415 239 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CNTFRP26992 372 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 KLRD1Q13241 179 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 AWAT1Q58HT5 328 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TEPPQ6URK8 271 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MGST2Q99735 147 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NNC1 897 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN9O75954 239 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTL6BO94805 426 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNA1P01562 189 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PRB1P04280 392 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 APELAP0DMC3 54 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFBP2P18065 325 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LGALS7P47929 136 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 EFNA4P52798 201 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB31Q13636 194 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf159Q96HA4 380 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SPG11Q96JI7 2443 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BQ15 152 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 YIF1AO95070 293 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-48P01763 117 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RBP4P02753 201 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 REG1AP05451 166 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR1DP28221 377 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OPRK1P41145 380 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 B2MP61769 119 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 WT1-ASQ06250 92 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TNXAQ16473 311 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf83Q53S99 150 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4A5Q8NH83 315 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 VAX2Q9UIW0 290 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCA1O95477 2261 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PN81 502 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CGB1A6NKQ9 187 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TIMM23O14925 209 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms