RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 TACC2O95359 2948 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 PDLIM4P50479 330 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 TEPPQ6URK8 271 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 RAB24Q969Q5 203 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SIRPDQ9H106 197 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CYB5BO43169 146 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 TNXAQ16473 311 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 MMD2Q8IY49 270 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 FBXL15Q9H469 300 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 VENTXO95231 258 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 REG1AP05451 166 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CEACAM3P40198 252 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CEBPGP53567 150 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 KHDC3LQ587J8 217 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CFHR4Q92496 578 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 FNDC10F2Z333 226 aa14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 BCL2P10415 239 aa14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CD24P25063 80 aa14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 GNB1P62873 340 aa14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 GAMTQ14353 236 aa14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 P2RX4Q99571 388 aa14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 CD69Q07108 199 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 C17orf50Q8WW18 174 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 FCN1O00602 326 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 TSPAN4O14817 238 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 ACTL6BO94805 426 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 APELAP0DMC3 54 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.121e-10■■■□□ 15.6
ACTB-201ENST00000331789 SSX2Q16385 188 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 FBLN7Q53RD9 439 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 CBLN2Q8IUK8 224 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 RNF5Q99942 180 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 TOX4O94842 621 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 B2MP61769 119 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 STPG3Q8N7X2 389 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SOX15O60248 233 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 AREGP15514 252 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 MAS1LP35410 378 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.31□□□□□ -0.123e-16■■□□□ 12.8
ACTB-201ENST00000331789 RAB31Q13636 194 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 TBX15Q96SF7 602 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PPV4 95 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 IFNA1P01562 189 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 LINC00869P0C866 280 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 AKR1C3P42330 323 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PMS2P11Q13670 270 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PLGLAQ15195 96 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 FAM168AQ92567 244 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 VAX2Q9UIW0 290 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.123e-13■□□□□ 8.3
ACTB-201ENST00000331789 M0R036 132 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-48P01763 117 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 LGALS4P56470 323 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PRR20EP86478 221 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PRR20CP86479 221 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PRR20DP86480 221 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PRR20BP86481 221 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PRR20AP86496 221 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 MMDQ15546 238 aa14.29□□□□□ -0.12
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