RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 NPBQ8NG41 125 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf58Q96LI9 332 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 C1RLQ9NZP8 487 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRK2Q5S007 2527 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB19A4D1S5 217 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC10F2Z333 226 aa8.1□□□□□ -1.11
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RABGGTB-201ENST00000319942 NBR2O15453 112 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MPDU1O75352 247 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CNIH1O95406 144 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1D-33P01593 117 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1-33P01594 117 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MBP02144 154 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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RABGGTB-201ENST00000319942 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.1□□□□□ -1.11
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RABGGTB-201ENST00000319942 TNXAQ16473 311 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 VWC2Q2TAL6 325 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 BTNL8Q6UX41 500 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 COMMD1Q8N668 190 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CFHR4Q92496 578 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
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RABGGTB-201ENST00000319942 HRH4Q9H3N8 390 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL15Q9H469 300 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SMCO3A2RU48 225 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN9O75954 239 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13C7P0DN81 318 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGGTB-201ENST00000319942 RUNX1Q01196 453 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF616Q08AN1 781 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGGTB-201ENST00000319942 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGGTB-201ENST00000319942 REG4Q9BYZ8 158 aa8.08□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.08□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS46E5RG02 174 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 I3L521 148 aa8.07□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM11P17152 192 aa8.07□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 CD24P25063 80 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TEPPQ6URK8 271 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.07□□□□□ -1.12
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