RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NEDD8Q15843 81 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 POU2AF1Q16633 256 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DL5AQ8N109 375 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GVQW1Q8N7I0 195 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 COMMD5Q9GZQ3 224 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 THYN1Q9P016 225 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T8A6NH00 312 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DEDDO75618 318 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PPYP01298 95 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR141Q7Z602 305 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 STPG3Q8N7X2 389 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 BEST4Q8NFU0 473 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 VN1R17PQ8TDU5 208 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM140Q9NV12 185 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
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CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 GDPD1Q8N9F7 314 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB34Q8NCN2 500 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A7Q9GZV3 580 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 RHBDL2Q9NX52 303 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FCER2P06734 321 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FXYD4P59646 89 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 WT1-ASQ06250 92 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CATR1Q13166 79 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SFXN4Q6P4A7 337 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 HOGA1Q86XE5 327 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM217Q8N7C4 229 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51H1Q8NH63 302 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRDL1Q9BU40 450 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP6D1Q9H9H5 199 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF2P09038 288 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13C7P0DN81 318 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 MFAP2P55001 183 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A24Q6NUK1 477 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 DMBX1Q8NFW5 382 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5B3Q8NH48 314 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf24Q9BUV8 137 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4C46A6NHA9 309 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 F8W735 103 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
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CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINE2P07093 398 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TPRA1Q86W33 373 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A38Q96DW6 304 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT14Q96FL9 552 aa18.91■□□□□ 0.62
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CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH10Q8IVF4 4471 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV18A0A075B6X5 111 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB5BO43169 146 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ADMP35318 185 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS9CQ6DKI2 356 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 APRG1Q8IVJ8 170 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5H6Q8NGV6 325 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 C21orf62Q9NYP8 219 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB9P28065 219 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF124Q15973 351 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 AADACL3Q5VUY0 350 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SPSB3Q6PJ21 355 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM17Q86X19 198 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SCARB1Q8WTV0 552 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF414Q96IQ9 312 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 COMMD9Q9P000 198 aa18.89■□□□□ 0.61
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CAPNS1-211ENST00000590874 K7EMT4 169 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UBAC2Q8NBM4 344 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CD300LFQ8TDQ1 290 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EIM0 57 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1L8Q8NGR8 309 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GIMAP1Q8WWP7 306 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH11A6NNE9 402 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC2LP0C7M8 214 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SDC2P34741 201 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MXD1Q05195 221 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V0BQ99437 205 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF2Q99496 336 aa18.86■□□□□ 0.61
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