RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SEC22AQ96IW7 307 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RAB18Q9NP72 206 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ALG5Q9Y673 324 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TENM3Q9P273 2699 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A0B4J293 547 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 M0QZK8 103 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 FGF16O43320 207 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SSNA1O43805 119 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 KBTBD11O94819 623 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2A4O95047 310 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 NDUFA3O95167 84 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CA2P00918 260 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CRYBA1P05813 215 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OR9G9P0C7N8 305 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RAG2P55895 527 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2B8PP59922 312 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 BLCAPP62952 87 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TATDN3Q17R31 274 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TEX45Q8NA69 505 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM56Q96MV1 263 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2A7Q96R45 310 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PHB2Q99623 299 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 NSG2Q9Y328 171 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RYR2Q92736 4967 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A0B4J2A0 478 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A0G2JRQ6 117 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 UPK2O00526 184 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 FCN1O00602 326 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CCSO14618 274 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ADAP1O75689 374 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SNAPC5O75971 98 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ACTL6BO94805 426 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CNIH1O95406 144 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 IFNA21P01568 189 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OPN1MWP04001 364 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 AMY1AP04745 511 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CRYGBP07316 175 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 MYOD1P15172 320 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 S100A12P80511 92 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TNXAQ16473 311 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 POU2AF1Q16633 256 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PRSS8Q16651 343 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 MMD2Q8IY49 270 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CADM3Q8N126 398 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 LRTM2Q8N967 370 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OR4A16Q8NH70 328 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 MITD1Q8WV92 249 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 IL22RA2Q969J5 263 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 GPR146Q96CH1 333 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OR51J1Q9H342 316 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 BET1LQ9NYM9 111 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A1B0GUS0 222 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 GOSR2O14653 212 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 NXPH3O95157 252 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 HLA-DRB1P01911 266 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 VDAC1P21796 283 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FXYD3Q14802 87 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 Q6ZSV7 163 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR4A5Q8NH83 315 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR1S1Q8NH92 325 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 HINT2Q9BX68 163 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PARP11Q9NR21 331 aa6.64□□□□□ -1.35
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