RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	CCS	O14618	274 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	NDP	Q00604	133 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	NMES1	Q9C002	83 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691		E7EUB6	86 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	OPN1MW	P04001	364 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	H2BFS	P57053	126 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	IL15RA	Q13261	267 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	FCN2	Q15485	313 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	STPG2	Q8N412	459 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1B0GW64	132 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	MYOD1	P15172	320 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	FOXL1	Q12952	345 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	SYNGR2	O43760	224 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	BRI3	O95415	125 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	SIX6	O95475	246 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	CRYGC	P07315	174 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	CXCL3	P19876	107 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	SLC35B1	P78383	322 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TBCD-223	ENST00000576691	WRB	O00258	174 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	CYB5B	O43169	146 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	PSMB6	P28072	239 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	RBKS	Q9H477	322 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691		G3V318	75 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691		H3BUA1	57 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	CTRB1	P17538	263 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	SNCA	P37840	140 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3	3e-6	■■■■□ 19.8
TBCD-223	ENST00000576691	CFHR3	Q02985	330 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	NOXA1	Q86UR1	476 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	DTD1	Q8TEA8	209 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691		U3KQ87	197 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	PSMB11	A5LHX3	300 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	IGHG4	P01861	327 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	RLN2	P04090	185 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	AREG	P15514	252 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	HTR2B	P41595	481 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TBCD-223	ENST00000576691	TAS2R30	P59541	319 aa		13.18	□□□□□ -0.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.4 ms