RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554196.1

LINC00520-202, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00520, Length 514 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-202ENST00000554196 LFNGQ8NES3 379 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 PERPQ96FX8 193 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 MMP26Q9NRE1 261 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 CHD6Q8TD26 2715 aa7.4□□□□□ -1.22
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LINC00520-202ENST00000554196 TEX46H3BTG2 121 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 TIMM23O14925 209 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 SLC25A17O43808 307 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 ACTL6BO94805 426 aa7.4□□□□□ -1.22
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LINC00520-202ENST00000554196 KLRD1Q13241 179 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 AANATQ16613 207 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 BSXQ3C1V8 233 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 C2orf83Q53S99 150 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 SPINK9Q5DT21 86 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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LINC00520-202ENST00000554196 CFHR4Q92496 578 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
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LINC00520-202ENST00000554196 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-202ENST00000554196 PTPN13Q12923 2485 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.39□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 NDUFA3O95167 84 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 HBE1P02100 147 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 MBP02144 154 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 IFNA4P05014 189 aa7.39□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 ZNF616Q08AN1 781 aa7.39□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 PRSS8Q16651 343 aa7.39□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 ZNF709Q8N972 641 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 ZNF114Q8NC26 417 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 MARC2Q969Z3 335 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 MALSU1Q96EH3 234 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 HINT2Q9BX68 163 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 REG4Q9BYZ8 158 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 KIAA1456Q9P272 454 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 B4DSR2 109 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 PRSS46E5RG02 174 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 I3L521 148 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 CORTO00230 105 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 RRHO14718 337 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 NBR2O15453 112 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 CA2P00918 260 aa7.38□□□□□ -1.23
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LINC00520-202ENST00000554196 ZP3P21754 424 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 FGF7P21781 194 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 BRS3P32247 399 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 RUNX1Q01196 453 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 EBI3Q14213 229 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 TOR2AQ5JU69 321 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 BTNL8Q6UX41 500 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 NPBQ8NG41 125 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 MBD6Q96DN6 1003 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 C1orf159Q96HA4 380 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 C1RLQ9NZP8 487 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 COL12A1Q99715 3063 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-202ENST00000554196 CREBBPQ92793 2442 aa7.37□□□□□ -1.23
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