RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	JTB	O76095	146 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	CNIH1	O95406	144 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	CDS2	O95674	445 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	FGF2	P09038	288 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	SPN	P16150	400 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	GNB1	P62873	340 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	TMEM187	Q14656	261 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	TRIM16L	Q309B1	348 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CS-231	ENST00000552222	UPK2	O00526	184 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TCRB	P04435	133 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222		P0C879	139 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	MAS1L	P35410	378 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	CFHR3	Q02985	330 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TNXA	Q16473	311 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TMEM56	Q96MV1	263 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222		G3V318	75 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ACTL6B	O94805	426 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ATG12	O94817	140 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	HLA-G	P17693	338 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	VDAC1	P21796	283 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	VAMP1	P23763	118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	IL22RA2	Q969J5	263 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	GON7	Q9BXV9	100 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	RETN	Q9HD89	108 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	SFT2D2	O95562	160 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ANXA3	P12429	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	SLC35B1	P78383	322 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	SRPX	P78539	464 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	NUDT15	Q9NV35	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	PRR13	Q9NZ81	148 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GW64	132 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222		E7EUB6	86 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	SNAPC5	O75971	98 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	IGHG4	P01861	327 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	OR4E1	P0C645	316 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	MYOD1	P15172	320 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	AKR1C2	P52895	323 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	OR2B8P	P59922	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	LGI3	Q8N145	548 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	COMMD1	Q8N668	190 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	OR5B12	Q96R08	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	SPIN2A	Q99865	258 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	PRND	Q9UKY0	176 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CS-231	ENST00000552222		A0A0B4J293	547 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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