RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 S1PR2O95136 353 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 HLA-DQA1P01909 254 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 CD33P20138 364 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 HOXC12P31275 282 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 IER3P46695 156 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 GNG10P50151 68 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 CX3CL1P78423 397 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 UBE2V1Q13404 147 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 MMDQ15546 238 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 TBC1D28Q2M2D7 210 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 C1orf185Q5T7R7 199 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 ZNF738Q8NE65 137 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 OR52E5Q8NH55 327 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 OR2D2Q9H210 308 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 GNB4Q9HAV0 340 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 GTF3C1Q12789 2109 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 A0A1W2PR80 420 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 CELA3BP08861 270 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 BMP5P22003 454 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RPL31P62899 125 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 Q6ZN92 141 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 NINJ1Q92982 152 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 SLC35D1Q9NTN3 355 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 BET1LQ9NYM9 111 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.75□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 OOEPA6NGQ2 149 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 AMTP48728 403 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 EDDM3BP56851 147 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RHOBP62745 196 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RBX1P62877 108 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 FAM57AQ8TBR7 257 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 OSTCQ9NRP0 149 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RAXQ9Y2V3 346 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 V9GYV3 84 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 IGF2RP11717 2491 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 ESPL1Q14674 2120 aa13.74□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 CGAP01215 116 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 GCHFRP30047 84 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RASL11AQ6T310 242 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 STPG4Q8N801 248 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 NAT8BQ9UHF3 227 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 DPRXA6NFQ7 191 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 K7EN84 100 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 SIRPB1O00241 398 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 TFPI2P48307 235 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 TREML4Q6UXN2 200 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 Q8NA96 180 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 A0A1W2PN81 502 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 NDUFB8O95169 186 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 COX11Q9Y6N1 276 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 ATMQ13315 3056 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 A0A1W2PS18 150 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 C17orf98A8MV24 154 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 SMPD2O60906 423 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RHBDL1O75783 438 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RAB31Q13636 194 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 BORCS7Q96B45 105 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 AMY1AP04745 511 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 FAM87AP0C7U9 286 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 CA6P23280 308 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 RPRMLQ8N4K4 120 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-208ENST00000494396 PIEZO1Q92508 2521 aa13.71□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 FNDC10F2Z333 226 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 SLC17A3O00476 420 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 ISLRO14498 428 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 CCL25O15444 150 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 DEFA4P12838 97 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 TSPOP30536 169 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 THBS3P49746 956 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 PSG7Q13046 419 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 RTL8BQ17RB0 113 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.7□□□□□ -0.22
SYP-208ENST00000494396 CORO2AQ92828 525 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms