RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 MMD2Q8IY49 270 aa7.08□□□□□ -1.28
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SNHG16-202ENST00000493536 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.08□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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SNHG16-202ENST00000493536 A0A1W2PN81 502 aa7.08□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.08□□□□□ -1.28
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SNHG16-202ENST00000493536 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.08□□□□□ -1.28
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SNHG16-202ENST00000493536 PAX8Q06710 450 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.07□□□□□ -1.28
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SNHG16-202ENST00000493536 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 C17orf50Q8WW18 174 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 CFHR4Q92496 578 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
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SNHG16-202ENST00000493536 MALSU1Q96EH3 234 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 FBXL15Q9H469 300 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 AUP1Q9Y679 476 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 APCP25054 2843 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM77I1YAP6 450 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 I3L521 148 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 FGF7P21781 194 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 FHITP49789 147 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 PRSS8Q16651 343 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 PARP11Q9NR21 331 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.07□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 E7EUB6 86 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 NPFFO15130 113 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 NBR2O15453 112 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 BRS3P32247 399 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 MAS1LP35410 378 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.287e-7■■■■■ 28.4
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SNHG16-202ENST00000493536 AANATQ16613 207 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 CNIH1O95406 144 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 TSPAN15O95858 294 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 OR13C7P0DN81 318 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 MARC2Q969Z3 335 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 GGACTQ9BVM4 153 aa7.06□□□□□ -1.28
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SNHG16-202ENST00000493536 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 AGPAT2O15120 278 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 CRYGBP07316 175 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 FAM106CPP0CH98 169 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM11P17152 192 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 SERF2P84101 59 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 C2orf83Q53S99 150 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 BTNL8Q6UX41 500 aa7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SNHG16-202ENST00000493536 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.284e-7■■■■□ 25
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