RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPM3Q9P2X0 92 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTBD17A6NE02 478 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LEUTXA8MZ59 168 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLDN34H7C241 214 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 J3QRK9 145 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BET1O15155 118 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HPGDSO60760 199 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NXPH4O95158 308 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCGR3AP08637 254 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HERPUD1Q15011 391 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MORN2Q502X0 79 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOB3BQ86TA1 216 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYG1Q8N1E2 194 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOMM40LQ969M1 308 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTX4Q96A99 478 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPEQ96AT9 228 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALMQ96C23 342 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MALSU1Q96EH3 234 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA2Q9UM82 520 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A6NDX4 124 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HELTA6NFD8 242 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRDCB7Z8K6 153 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD17B6O14756 317 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FABP7O15540 132 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UCP1P25874 307 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TALDO1P37837 337 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGL1Q08830 312 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HACD4Q5VWC8 232 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM17Q86X19 198 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM86BQ8N661 226 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC160A6NGH7 325 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINE3A8MV23 424 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VGLL3A8MV65 326 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BMQ9 156 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCGNO76038 276 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRYBA1P05813 215 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELK1P19419 428 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEACAM3P40198 252 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEACAM6P40199 344 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RORCP51449 518 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAS2R20P59543 309 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNG2P59768 71 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BLCAPP62952 87 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HES1Q14469 280 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZRP5 223 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ISOC1Q96CN7 298 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RCHY1Q96PM5 261 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THYN1Q9P016 225 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 JPT1Q9UK76 154 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VWFP04275 2813 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM25AB3EWG3 89 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM25CB3EWG5 89 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM25GB3EWG6 89 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YPEL1O60688 119 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV1D-33P01593 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV1-33P01594 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGF1P05019 195 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF735P0CB33 412 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RANBP1P43487 201 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-3P60369 221 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.51□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00311Q8N616 119 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms