RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566376.3

TCF4-233, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 462 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TNFSF12	O43508	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	FCGR3B	O75015	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	KBTBD11	O94819	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	PPY	P01298	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TRGV3	P03979	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	MFAP2	P55001	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TAS2R20	P59543	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	CDK10	Q15131	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	PLGLA	Q15195	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	CTF1	Q16619	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ASCL2	Q99929	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376		H3BUA1	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	S1PR2	O95136	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	GABARAP	O95166	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	CSN3	P07498	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	GP9	P14770	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	FCGR2C	P31995	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	LGALS7	P47929	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	GNG2	P59768	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	VBP1	P61758	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	FHL2	Q14192	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TNXA	Q16473	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376		S4R3C0	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376		A0A0A6YYH2	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376		A6NJ64	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	XRCC3	O43542	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	AIRE	O43918	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	SAP30	O75446	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	NDUFB8	O95169	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	REG1A	P05451	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	CRYGC	P07315	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	CTRB1	P17538	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ELK1	P19419	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	GNRHR	P30968	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	RFX2	P48378	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	RHOG	P84095	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	MSMO1	Q15800	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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