RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 NOXA1Q86UR1 476 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ENY2Q9NPA8 101 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CACNG5Q9UF02 275 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ZNF580Q9UK33 172 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 MTORP42345 2549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 VPS13CQ709C8 3753 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 GPR137BO60478 399 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PITX3O75364 302 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 IFNA17P01571 189 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CRYBA1P05813 215 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CD24P25063 80 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ID3Q02535 119 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 FCN2Q15485 313 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 Q8N9W7 124 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 RAB40CQ96S21 281 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 FBXL15Q9H469 300 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PRR13Q9NZ81 148 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 TNCP24821 2201 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR9G9P0C7N8 305 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PSMB6P28072 239 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 TAS2R30P59541 319 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PRCDQ00LT1 54 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 TNFRSF9Q07011 255 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 FXYD3Q14802 87 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 TNXAQ16473 311 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 LY6EQ16553 131 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 AKAP14Q86UN6 197 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 RITA1Q96K30 269 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR10C1Q96KK4 312 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 AP4M1O00189 453 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 SYNGR2O43760 224 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CCNKO75909 580 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CA2P00918 260 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 IGHG2P01859 326 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PAX6P26367 422 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CNTFRP26992 372 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 H2BFSP57053 126 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CX3CL1P78423 397 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 IL15RAQ13261 267 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 Q6ZRM9 215 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 TMEM219Q86XT9 240 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 THAP6Q8TBB0 222 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ARPC1AQ92747 370 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CHIAQ9BZP6 476 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 U3KQ87 197 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 A0A0G2JRQ6 117 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 E5RGE8 158 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 L7N2F9 121 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 CORTO00230 105 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 CCSO14618 274 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 IGF1P05019 195 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 CXCL3P19876 107 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 SNCAP37840 140 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 HTR2BP41595 481 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 OR2B8PP59922 312 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-220ENST00000550700 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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