RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ARPC1AQ92747 370 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RAB24Q969Q5 203 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 C20orf173Q96LM9 149 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MS4A10Q96PG2 267 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR5B12Q96R08 314 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF580Q9UK33 172 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 FABP12A6NFH5 140 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MSGN1A6NI15 193 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 GABARAPH6UMI1 98 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TPPPO94811 219 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 IFNA6P05013 189 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RPA2P15927 270 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MALP21145 153 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 KRTAP10-11P60412 298 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CATR1Q13166 79 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MSMO1Q15800 293 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PRSS8Q16651 343 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 DEFB136Q30KP8 78 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PHB2Q99623 299 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 U3KQK5 164 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CCL24O00175 119 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 GPR31O00270 319 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ACTL6BO94805 426 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RAB3DO95716 219 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 HRASP01112 189 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RLN1P04808 185 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 KIR2DS2P43631 304 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 LPAR6P43657 344 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RAB25P57735 213 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 VAMP2P63027 116 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 POC5Q8NA72 575 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 BORCS5Q969J3 196 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 GNB4Q9HAV0 340 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR2A4O95047 310 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 S1PR2O95136 353 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TNFRSF6BO95407 300 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 HPRT1P00492 218 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 MYOD1P15172 320 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 PGAM2P15259 253 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 PI3P19957 117 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 CD40LGP29965 261 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 MYCNOSP40205 109 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 UCP3P55916 312 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TPPP2P59282 170 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TAS2R19P59542 299 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 MMD2Q8IY49 270 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 OR2A7Q96R45 310 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SOSTQ9BQB4 213 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 VSIG4Q9Y279 399 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 DPPA5A6NC42 116 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 HMX3A6NHT5 357 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 E7EUB6 86 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 CTDSPLO15194 276 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 MPPED1O15442 326 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 KBTBD11O94819 623 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 KRASP01116 189 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 IGHV3-11P01762 117 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TRGV3P03979 118 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 CD74P04233 296 aa7.45□□□□□ -1.22
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