RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	RUNX1	Q01196	453 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF846	Q147U1	533 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	OR4C6	Q8NH72	309 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	GPR84	Q9NQS5	396 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM213	A2RRL7	107 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	C19orf84	I3L1E1	186 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	SLC22A1	O15245	554 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	YKT6	O15498	198 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	KRT75	O95678	551 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	SHBG	P04278	402 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	HLA-DMB	P28068	263 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	RAB13	P51153	203 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	CXCR4	P61073	352 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	PMS2P3	Q13401	168 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	ANKRD7	Q92527	254 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	DERL2	Q9GZP9	239 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	AK3	Q9UIJ7	227 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	PTPRS	Q13332	1948 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	USP24	Q9UPU5	2620 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204		I3L521	148 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	S100A7	P31151	101 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	CD302	Q8IX05	232 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	TREM1	Q9NP99	234 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	C21orf140	B9A014	251 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	LST1	O00453	97 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	IGHV3-7	P01780	117 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	KRT7	P08729	469 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	OR4D2	P58180	307 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	FAM78B	Q5VT40	261 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204		Q8N6K4	173 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	KIF15	Q9NS87	1388 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-233	ENST00000545204	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	C1QA	P02745	245 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	CLPS	P04118	112 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	PET100	P0DJ07	73 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	DMTN	Q08495	405 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	ANGPT1	Q15389	498 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	FUT9	Q9Y231	359 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	COCH	O43405	550 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	HPGDS	O60760	199 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	YEATS4	O95619	227 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	HLA-DRA	P01903	254 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	IL3	P08700	152 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	FGF6	P10767	208 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	UGT2B7	P16662	529 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	CCL1	P22362	96 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	MGAT3	Q09327	533 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	SMIM19	Q96E16	107 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	WDR54	Q9H977	334 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	LAMA4	Q16363	1823 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-233	ENST00000545204	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		0.13	□□□□□ -2.39

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