RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 PLA2G7Q13093 441 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 FRZBQ92765 325 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 POMPQ9Y244 141 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.27□□□□□ -1.25
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KDM5A-211ENST00000544777 A0A0A6YYD4 124 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 J3QL48 77 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 RAB27BO00194 218 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 IGSF11Q5DX21 431 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 Q5VSD8 79 aa7.26□□□□□ -1.25
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KDM5A-211ENST00000544777 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.26□□□□□ -1.25
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KDM5A-211ENST00000544777 KCNK15Q9H427 330 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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KDM5A-211ENST00000544777 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 MYCBP2O75592 4640 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 LALBAP00709 142 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 CD5P06127 495 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 GABRB1P18505 474 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 CELP19835 753 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 C4BPBP20851 252 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 ETV1P50549 477 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 GYS2P54840 703 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 UNC119Q13432 240 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 KCTD9Q7L273 389 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TCF24Q7RTU0 167 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 DERL3Q96Q80 235 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 GINS4Q9BRT9 223 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 ATG101Q9BSB4 218 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 HSF4Q9ULV5 492 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 AP4S1Q9Y587 144 aa7.25□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.24□□□□□ -1.25
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KDM5A-211ENST00000544777 HLA-GP17693 338 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP10-2P60368 255 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 OR4S2Q8NH73 311 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 ATP6V0BQ99437 205 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 PECRQ9BY49 303 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.24□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 CGB1A6NKQ9 187 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 YIF1AO95070 293 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 DIRAS3O95661 229 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 BPNT1O95861 308 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 HTN3P15516 51 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 DCKP27707 260 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM50BP56557 158 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 QRFPP83859 136 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 SSX1Q16384 188 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 Q56UQ5 140 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.23□□□□□ -1.25
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.22□□□□□ -1.25
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