RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431099.3

CBWD1-208, Transcript of COBW domain containing 1, human

TSL 5

Gene CBWD1, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD1-208	ENST00000431099	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	TRGV3	P03979	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	PSMB9	P28065	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	MAS1L	P35410	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	CBX5	P45973	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR10A3	P58181	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	TPPP2	P59282	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ARPC4	P59998	168 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	CDK10	Q15131	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	CADM3	Q8N126	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099		U3KQK5	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099		A0A0B4J203	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099		H0Y980	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	SAP30	O75446	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	DHFR	P00374	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	HRAS	P01112	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	GNG2	P59768	71 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	PRSS8	Q16651	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099		A0A087WW49	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	CRYZL1	O95825	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	GP9	P14770	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	SDC2	P34741	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099		A0A075B6Q4	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD1-208	ENST00000431099	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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