RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 SRD5A2P31213 254 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 OPRK1P41145 380 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF134P52741 427 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 HTD2P86397 168 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 RASL11AQ6T310 242 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 FAM58AQ8N1B3 248 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF645Q8N7E2 425 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00482Q8N8I6 264 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CORO2AQ92828 525 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM45BQ96B21 275 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 STARD4Q96DR4 205 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 RNF125Q96EQ8 232 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00470Q9BZP3 86 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CHD6Q8TD26 2715 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 FCN1O00602 326 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 TCF21O43680 179 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFB4O95168 129 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 TOMM40O96008 361 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DQA1P01909 254 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 GPX1P07203 203 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CCL3P10147 92 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 B4GALT1P15291 398 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 WNT5AP41221 380 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 LHX2P50458 406 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 GPM6AP51674 278 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CARD18P57730 90 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2G2P60604 165 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 GNB1P62873 340 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 PLGLB1Q02325 96 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2V1Q13404 147 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 RAB31Q13636 194 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 BATFQ16520 125 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 RTL8BQ17RB0 113 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF585BQ52M93 769 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA45Q537H7 98 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 PRR31Q5SQ13 230 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf52Q96A22 123 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 BORCS7Q96B45 105 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 KCNS1Q96KK3 526 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 S1PR2O95136 353 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 AREGP15514 252 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 ARR3P36575 388 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CTRLP40313 264 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 GNG10P50151 68 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 RDH5Q92781 318 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CEP250Q9BV73 2442 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0J9YW62 118 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 A6NNC1 897 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF716A6NP11 495 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 SNURFLB1AK76 121 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 J3QT63 122 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 CDIPTO14735 213 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 ZIC3O60481 467 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 WDR1O75083 606 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 P0C879 139 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 STAG3L2P0CL84 134 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 STAG3L3P0CL85 134 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 IGLC2P0DOY2 106 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 IGLC3P0DOY3 106 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS3P57727 454 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 PLP2Q04941 152 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZN92 141 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 VASH2Q86V25 355 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 LRP11Q86VZ4 500 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 DRAM1Q8N682 238 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-201ENST00000372616 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms