RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	WBP1	Q96G27	269 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	TP53RK	Q96S44	253 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	USF3	Q68DE3	2245 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	H2BFS	P57053	126 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	SMIM8	Q96KF7	97 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151		H0YL77	283 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151		J3QR89	54 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	NPPC	P23582	126 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	CDKN1A	P38936	164 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	TGFA	P01135	160 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	RAB9A	P51151	201 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	NMB	P08949	121 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	APCS	P02743	223 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	FREM3	P0C091	2139 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	MAS1L	P35410	378 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	HERVK_113	P61574	105 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAB18-208	ENST00000611151	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151		A0A0G2JK05	382 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	IL4	P05112	153 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	TRGV3	P03979	118 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	LYPD3	O95274	346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	RNF224	P0DH78	156 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	TWIST1	Q15672	202 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	CA2	P00918	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	PF4	P02776	101 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	RAX2	Q96IS3	184 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	UCP1	P25874	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151		H3BTX0	84 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	PSG9	Q00887	426 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	GALNT14	Q96FL9	552 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	MOS	P00540	346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	CCL3L1	P16619	93 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	MST1	P26927	711 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	TBR1	Q16650	682 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	EFNA2	O43921	213 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	TIMP3	P35625	211 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	FOXF2	Q12947	444 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAB18-208	ENST00000611151	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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