RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 USF3Q68DE3 2245 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 hADV38S2A0JD32 116 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 C15orf61A6NNL5 157 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 H7BYZ3 331 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 PHOX2AO14813 284 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPP1R2P9O14990 202 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMPRSS2O15393 492 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 PAGE4O60829 102 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 CXorf1O96002 111 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGHV1-46P01743 117 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 FABP1P07148 127 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 IRF2P14316 349 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 TNFRSF1AP19438 455 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 CD40P25942 277 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 EDDM3BP56851 147 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 LINC00205P59089 165 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 TLE1Q04724 770 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 TFF3Q07654 80 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 HNF4GQ14541 408 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 LTC4SQ16873 150 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 TREML4Q6UXN2 200 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 RHOVQ96L33 236 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 PARLQ9H300 379 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 ENY2Q9NPA8 101 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM140Q9NV12 185 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRNDQ9UKY0 176 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 TCF19Q9Y242 345 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2CP1-201ENST00000557130 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.34□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 GTF3C1Q12789 2109 aa6.34□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 C11orf94C9JXX5 98 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 C16orf97H3BN30 126 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 UPK2O00526 184 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 RRHO14718 337 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 YIF1AO95070 293 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 MT-CO2P00403 227 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 GYPAP02724 150 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 TYMSP04818 313 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRGC1P0CF51 173 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 STAG3L2P0CL84 134 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 STAG3L3P0CL85 134 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 LCN2P80188 198 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 FOXL1Q12952 345 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADIRFQ15847 76 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPRNQ5BIV9 151 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 TEPPQ6URK8 271 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 FRZBQ92765 325 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 GAFA1Q96PS6 74 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC25A22Q9H936 323 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPP5D1E7EU14 171 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRRG2O14669 202 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC31A2O15432 143 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 AREGP15514 252 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 NPPCP23582 126 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 GALR1P47211 349 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 RHOBP62745 196 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM27E3Q08E93 113 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 RTL8BQ17RB0 113 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPINK9Q5DT21 86 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 OR4A47Q6IF82 309 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 VHLLQ6RSH7 139 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 SSX9Q7RTT3 188 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 PNKDQ8N490 385 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF383Q8NA42 475 aa6.32□□□□□ -1.4
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