RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533170.1

AP003555.2-202, humanhuman

TSL 3

Gene AP003555.2, Length 369 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003555.2-202ENST00000533170 HLA-DOBP13765 273 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ATP4BP51164 291 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 CCL23P55773 120 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 HERVK_113P63121 156 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 Q0VG73 95 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 GSG1Q2KHT4 349 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 PYDC2Q56P42 97 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 Q56UQ5 140 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 LCN12Q6JVE5 192 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ACP7Q6ZNF0 438 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 SLC25A45Q8N413 288 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 OR9G1Q8NH87 305 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 LMO3Q8TAP4 145 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 RPS4Y2Q8TD47 263 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 DNAJA3Q96EY1 480 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 KCNS1Q96KK3 526 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 RNF7Q9UBF6 113 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 CUL7Q14999 1698 aa4.7□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 PIK3C2BO00750 1634 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ABCA6Q8N139 1617 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 A0A0D9SFI3 127 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 C5orf63A6NC05 138 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 GABARAPH6UMI1 98 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 XKRYO14609 159 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 RRHO14718 337 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 PITX3O75364 302 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 PROSCO94903 275 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 NXPH3O95157 252 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 WNT1P04628 370 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 IGKV5-2P06315 115 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 H2AFZP0C0S5 128 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 OR9G9P0C7N8 305 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 PGA5P0DJD9 388 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 SAA4P35542 130 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 C1QTNF8P60827 252 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF726P1Q15940 193 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 UBE2NLQ5JXB2 153 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 VAX1Q5SQQ9 334 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 Q6ZRU5 148 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 DEFB107AQ8IZN7 70 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ATOH7Q8N100 152 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ZFP41Q8N8Y5 198 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF709Q8N972 641 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 MAL2Q969L2 176 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 MS4A6EQ96DS6 147 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 MEIS3Q99687 375 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TM2D2Q9BX73 214 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 LIME1Q9H400 295 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TMEM100Q9NV29 134 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 CLCF1Q9UBD9 225 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 PXMP4Q9Y6I8 212 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 CHD4Q14839 1912 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TNS2Q63HR2 1409 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 FOCADQ5VW36 1801 aa4.69□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 CLTCL1P53675 1640 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 SCN11AQ9UI33 1791 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 KIF1AQ12756 1690 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 IRGMA1A4Y4 181 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 J3QT63 122 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 AGPAT2O15120 278 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 NPIPB7O75200 414 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 HYPMO75409 117 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 UBL3O95164 117 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 IGHG1P01857 330 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 ATP1B1P05026 303 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 PYYP10082 97 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 SLC25A4P12235 298 aa4.68□□□□□ -1.66
AP003555.2-202ENST00000533170 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms