RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 A6NJ64 397 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 G3V4G9 280 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C15orf65H3BRN8 121 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 NBR2O15453 112 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FCGR3BO75015 233 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SCGB2A1O75556 95 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1D-12P01611 117 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MT-ND4P03905 459 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CDK1P06493 297 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CD28P10747 220 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CD36P16671 472 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MYL9P24844 172 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PSMB8P28062 276 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HTR2CP28335 458 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 S100GP29377 79 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 KIR2DS2P43631 304 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 BLCAPP62952 87 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ST3GAL4Q11206 333 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PLGLAQ15195 96 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MORN2Q502X0 79 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZS49 121 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 Q8N6K4 173 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM104Q8NE00 496 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SETD6Q8TBK2 473 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DERL3Q96Q80 235 aa3.25□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FAM223BA6NKX1 122 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS46E5RG02 174 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LINC01619G3V211 115 aa3.24□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 HBZP02008 142 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MAS1P04201 325 aa3.24□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 CD5P06127 495 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 UCHL1P09936 223 aa3.24□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 CELP19835 753 aa3.24□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 BMI1P35226 326 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SSTR5P35346 364 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MAS1LP35410 378 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP10-12P60413 245 aa3.24□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 SPHARQ15513 63 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HMGN3Q15651 99 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR4A47Q6IF82 309 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LCN12Q6JVE5 192 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TPRA1Q86W33 373 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LYG1Q8N1E2 194 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FGFRL1Q8N441 504 aa3.24□□□□□ -1.89
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