RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	PIP4P1	Q86T03	277 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	LINC01551	Q86U37	167 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF114	Q8NC26	417 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	OR1L1	Q8NH94	360 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	SGCZ	Q96LD1	299 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CLN8	Q9UBY8	286 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	GTF3C1	Q12789	2109 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034		A0A0U1RQK1	487 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF320	A2RRD8	509 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034		F6UZH7	168 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	SIRPB1	O00241	398 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	F2RL2	O00254	374 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ZG16	O60844	167 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	RAMP3	O60896	148 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	TNFSF13	O75888	250 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CLDN1	O95832	211 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	OR2H2	O95918	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034		P04436	131 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CCL4	P13236	92 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	EGR1	P18146	543 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	COX5A	P20674	150 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CCNO	P22674	350 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	GCH1	P30793	250 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	G6PC	P35575	357 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ARR3	P36575	388 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ATP5G3	P48201	142 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CLDN18	P56856	261 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF146	Q15072	292 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	MSMO1	Q15800	293 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	AARD	Q4LEZ3	155 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034		Q6ZWC4	215 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF573	Q86YE8	665 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034		Q8N976	141 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	RAB1C	Q92928	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	R3HDM4	Q96D70	268 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CHODL	Q9H9P2	273 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	RTTN	Q86VV8	2226 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	ESPL1	Q14674	2120 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	RNF212B	A8MTL3	300 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	C11orf94	C9JXX5	98 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	PRSS46	E5RG02	174 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034		M0QZK8	103 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	DLEU1	O43261	78 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	PDE6D	O43924	150 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAPPC6A	O75865	159 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	NEURL1	O76050	574 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	S1PR2	O95136	353 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	SYNGR4	O95473	234 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	CLDN14	O95500	239 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	SCGB1D1	O95968	90 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	MT-CO3	P00414	261 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SUMO1-210	ENST00000469034	HPRT1	P00492	218 aa		3.87	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms