RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 LINC01548A6NM66 108 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CDS2O95674 445 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TCRBP04435 133 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 AKR1C4P17516 323 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 DEFA1P59665 94 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 DEFA3P59666 94 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ERVK-16P61578 105 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 NDPQ00604 133 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SP6Q3SY56 376 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SSX9Q7RTT3 188 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SEC22AQ96IW7 307 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 PALMDQ9NP74 551 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM140Q9NV12 185 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ATP6V0E1O15342 81 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 KRASP01116 189 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ANXA3P12429 323 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 G6PCP35575 357 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM187Q14656 261 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM16LQ309B1 348 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 STPG2Q8N412 459 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 DMBX1Q8NFW5 382 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 IL22RA2Q969J5 263 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM56Q96MV1 263 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CLCC1Q96S66 551 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 UPK2O00526 184 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ATG12O94817 140 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 P0C879 139 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 MAS1LP35410 378 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SRPXP78539 464 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R1AQ13522 171 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 FXYD3Q14802 87 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ENKURQ8TC29 256 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ARPC1AQ92747 370 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 PARP11Q9NR21 331 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 NUDT15Q9NV35 164 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 FBXO7Q9Y3I1 522 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 STAB1Q9NY15 2570 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV3A0A0B4J244 114 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SFT2D2O95562 160 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1-5P01602 117 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 VAMP1P23763 118 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CFHR3Q02985 330 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TNXAQ16473 311 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 LRTM2Q8N967 370 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 GON7Q9BXV9 100 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 HAX1O00165 279 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ACTL6BO94805 426 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CNIH1O95406 144 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 OR4E1P0C645 316 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 OR9G9P0C7N8 305 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-GP17693 338 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 AKR1C2P52895 323 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 GNB1P62873 340 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM268Q5VZI3 342 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF695Q8IW36 515 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 FAM219AQ8IW50 185 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 LGI3Q8N145 548 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TENM1Q9UKZ4 2725 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV41A0A0B4J266 112 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0B4J2A0 478 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf170A2RU37 121 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 PSMB11A5LHX3 300 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 C15orf61A6NNL5 157 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 SNAPC5O75971 98 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 VDAC1P21796 283 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms