RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cacna1bO55017 2327 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bod1lE9Q6J5 3032 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv1-135A0A0B4J1H7 120 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5890A0A140LI04 305 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr740E9PV79 311 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ColqO35348 457 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd8bP10300 213 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mas1P30554 324 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Perm1Q149B8 807 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Osgin2Q3TEE9 550 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr11Q60890 313 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AgaQ64191 346 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HaaoQ78JT3 286 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ErasQ7TN89 227 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1000Q7TR99 314 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aqp11Q8BHH1 271 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exosc6Q8BTW3 273 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc24a5Q8C261 501 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssxb2Q8C5Z3 165 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbpms2Q8VC52 206 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RhovQ8VDU1 236 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1298Q8VGE6 312 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Golt1aQ9DCQ3 133 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col6a3E9PWQ3 3284 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-42A0A0A6YY38 117 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl23a-ps3A0A140T8M7 156 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SiglechB7ZMQ6 332 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr64F8VPZ8 307 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd46O88174 365 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01746 140 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sod1P08228 154 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rims4P60191 269 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S100a3P62818 101 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UbdP63072 162 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DhhQ61488 396 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PnlipQ6P8U6 465 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LgalslbQ7TPX9 165 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr132Q7TRI8 313 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpne4Q8BLR2 557 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr84Q8CIM5 396 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cadm4Q8R464 388 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MrgprfQ8VCJ6 343 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1420Q8VF55 309 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr435Q8VFS3 313 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mus81Q91ZJ0 551 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mansc1Q9CR33 414 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lyzl6Q9DA11 148 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smdt1Q9DB10 107 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RprmQ9JJ72 109 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd5lQ9QWK4 352 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S1pr3Q9Z0U9 378 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem196V9GX04 182 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col4a4Q9QZR9 1682 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trbv5A0A0B4J1G9 113 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1220F7BL62 311 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20815J3KMI0 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20914J3QME2 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r128L7N2B4 307 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klk1b1P00755 261 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtatp6P00848 226 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PomcP01193 235 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hbb-yP02104 147 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SellP18337 372 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LalbaP29752 143 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PpicP30412 212 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defb25Q30KN8 71 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lefty1Q64280 368 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oxgr1Q6IYF8 337 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21292Q78EE2 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrtm1Q8BXQ3 356 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r4Q8R2D3 297 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubg2Q8VCK3 451 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr56Q8VGD6 315 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr181Q8VGQ7 317 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc29a3Q99P65 475 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smim8Q9CQQ0 97 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tm7sf3Q9CRG1 565 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspb9Q9DAM3 168 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tet1Q3URK3 2007 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Celsr3Q91ZI0 3301 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm29049A0A087WSM5 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3676D3Z236 184 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10638F6QEG2 257 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20403G3UYB0 123 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21118J3QPK8 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-M10.1O19443 331 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CamlgP49070 294 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hhipl1Q14DK5 791 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20909Q5FWB5 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tsr3Q5HZH2 323 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20852Q5M8R5 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taar8bQ5QD06 344 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20917Q62457 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20809Q62458 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20865Q62460 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp874bQ7M6X2 447 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbll1Q80WS3 314 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20738Q810R8 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37 ms