RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TGOLN2	O43493	480 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ORC5	O43913	435 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2J2	O76002	312 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	UBL3	O95164	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CD74	P04233	296 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ATF1	P18846	271 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CRABP1	P29762	137 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HRH1	P35367	487 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CAV2	P51636	162 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1CB	P62140	327 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SELENOT	P62341	195 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	LCN6	P62502	163 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RAP1A	P62834	184 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNJ8	Q15842	424 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		Q499Y3	187 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SPIC	Q8N5J4	248 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8G5	Q8NG78	346 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR9G1	Q8NH87	305 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OTOS	Q8NHW6	89 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HGD	Q93099	445 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	S100PBP	Q96BU1	408 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	DDIT4L	Q96D03	193 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C18orf12	Q96KH6	178 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	P2RX4	Q99571	388 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MED11	Q9P086	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CHD6	Q8TD26	2715 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		3.78	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTA1	P02549	2419 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GUV1	79 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM212	A6NML5	194 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	AIP	O00170	330 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CRLF1	O75462	422 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DHFR	P00374	187 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHM	P01871	453 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF823	P16415	610 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC6A1	P30531	599 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB25	P57735	213 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	LY6D	Q14210	128 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	HES5	Q5TA89	166 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZS92	163 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC7A6	Q92536	515 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM56	Q96MV1	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DERL3	Q96Q80	235 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RBP7	Q96R05	134 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCG5	Q9H222	651 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ARV1	Q9H2C2	271 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNG2	Q9Y698	323 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0B4J2A0	478 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	VENTX	O95231	258 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CTLA4	P16410	223 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PFN2	P35080	140 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DLX1	P56177	255 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF266	Q14584	549 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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