RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NAA60Q9H7X0 242 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSPAN9O75954 239 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDUFA3O95167 84 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRASP01116 189 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TCRBP04435 133 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR5AC1P0C628 307 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RRASP10301 218 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC6A1P30531 599 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIR2DS2P43631 304 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RIPPLY3P57055 190 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP10-3P60369 221 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDPQ00604 133 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LIN54Q6MZP7 749 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 POC5Q8NA72 575 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR4S2Q8NH73 311 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC01006Q8NI28 216 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BORCS5Q969J3 196 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RNF5Q99942 180 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NSG2Q9Y328 171 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM89A2RUT3 159 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FGF16O43320 207 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDUFA7O95182 113 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HPRT1P00492 218 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CA2P00918 260 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGKV1-5P01602 117 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OPN1MWP04001 364 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR9G9P0C7N8 305 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ECI1P42126 302 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LGALS7P47929 136 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBE2KP61086 200 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GNB1P62873 340 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CX3CL1P78423 397 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CBX3Q13185 183 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPP1R1AQ13522 171 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM187Q14656 261 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLGLAQ15195 96 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR4A47Q6IF82 309 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 R3HDM4Q96D70 268 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C16orf95Q9H693 158 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB18Q9NP72 206 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIAA1456Q9P272 454 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A0G2JRQ6 117 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 E7EUB6 86 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 G3V318 75 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 H0Y980 276 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.091e-5■■■■□ 19.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SERPINE2P07093 398 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 APELAP0DMC3 54 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UCP1P25874 307 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 S100GP29377 79 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DHODHQ02127 395 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRSS8Q16651 343 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRIM16LQ309B1 348 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q8N2B8 174 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TEX45Q8NA69 505 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms