RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 TP53RKQ96S44 253 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 NDUFS7O75251 213 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CLDN1O95832 211 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 EFNA4P52798 201 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 UBE2KP61086 200 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 UTF1Q5T230 341 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 OVOL3O00110 214 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 IGHV2-5P01817 119 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CXCL1P09341 107 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 COX6B1P14854 86 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 LOXL3P58215 753 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 KHDC3LQ587J8 217 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 NECAP1Q8NC96 275 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 ASB13Q8WXK3 278 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 OR2D2Q9H210 308 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RAB18Q9NP72 206 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RNF150Q9ULK6 438 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SLC31A2O15432 143 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 YPEL1O60688 119 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 MORN2Q502X0 79 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 YPEL2Q96QA6 119 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.15□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 PTPN13Q12923 2485 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 DRAM1Q8N682 238 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF714Q96N38 554 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 OR8B2Q96RD0 313 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CCL19Q99731 98 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PSG11Q9UQ72 335 aa7.15□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 F2RP25116 425 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 LGI3Q8N145 548 aa7.14□□□□□ -1.27
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THBS3-210ENST00000541576 OR51H1Q8NH63 302 aa7.14□□□□□ -1.27
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THBS3-210ENST00000541576 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.14□□□□□ -1.27
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THBS3-210ENST00000541576 MMP9P14780 707 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CCL3L1P16619 93 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ERVFRD-1P60508 538 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SRPXP78539 464 aa7.14□□□□□ -1.27
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THBS3-210ENST00000541576 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 LRTM2Q8N967 370 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 AGMATQ9BSE5 352 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 H0Y980 276 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 MMP23AO75900 390 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 WNT2P09544 360 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HKR1P10072 659 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PLA2G2AP14555 144 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CCL20P78556 96 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 MSMO1Q15800 293 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 Q8WTZ3 238 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SMIM8Q96KF7 97 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 C18orf12Q96KH6 178 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TUBA4BQ9H853 241 aa7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TENM4Q6N022 2769 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SMCO3A2RU48 225 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IFNA21P01568 189 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF134P52741 427 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IL15RAQ13261 267 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 RHEBQ15382 184 aa7.13□□□□□ -1.27
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