RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 HSPB7Q9UBY9 170 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 SPINT2O43291 252 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 CRYAAP02489 173 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 EDDM3BP56851 147 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 HBG1P69891 147 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 HBG2P69892 147 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 CATR1Q13166 79 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 C1orf185Q5T7R7 199 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa10.68□□□□□ -0.7
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PRAME-213ENST00000492657 GZMBP10144 247 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ZNF134P52741 427 aa10.67□□□□□ -0.7
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PRAME-213ENST00000492657 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 CBLN4Q9NTU7 201 aa10.67□□□□□ -0.7
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PRAME-213ENST00000492657 FAM90A26D6RGX4 464 aa10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-213ENST00000492657 IGKV1-33P01594 117 aa10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-213ENST00000492657 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-213ENST00000492657 A6NNC1 897 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 CEBPZOSA8MTT3 80 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 FCGR3BO75015 233 aa10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-213ENST00000492657 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 NBASA2RRP1 2371 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-213ENST00000492657 DCAF16Q9NXF7 216 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 MARCH11A6NNE9 402 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 A8MWP6 167 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 M0R1X1 148 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 RAB29O14966 203 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 DUTP33316 252 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 HTD2P86397 168 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 ACSM6Q6P461 480 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 OR5T1Q8NG75 326 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-213ENST00000492657 PMS2P5A8MQ11 134 aa10.65□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 MGST3O14880 152 aa10.65□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 ADH4P08319 380 aa10.65□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 SPCS3P61009 180 aa10.65□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 TFF3Q07654 80 aa10.65□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 MZT1Q08AG7 82 aa10.65□□□□□ -0.71
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PRAME-213ENST00000492657 FAM90A1Q86YD7 464 aa10.65□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 Q8TCH9 128 aa10.65□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 R3HDM4Q96D70 268 aa10.65□□□□□ -0.71
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PRAME-213ENST00000492657 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa10.65□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 DYSFO75923 2080 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 DEFA4P12838 97 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 GZMHP20718 246 aa10.64□□□□□ -0.71
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PRAME-213ENST00000492657 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 OR4X1Q8NH49 305 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 NEU1Q99519 415 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-213ENST00000492657 LHBP01229 141 aa10.64□□□□□ -0.71
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