RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	DTD1	Q8TEA8	209 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM168A	Q92567	244 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RHOV	Q96L33	236 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	HARBI1	Q96MB7	349 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	WFDC1	Q9HC57	220 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ARID1A	O14497	2285 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	C15orf61	A6NNL5	157 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	IFNA17	P01571	189 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	NMB	P08949	121 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SULT1A1	P50225	295 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB13	P51153	203 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	DYNLT3	P51808	116 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	LCN2	P80188	198 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CLINT1	Q14677	625 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM177	Q53S58	311 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SPINK9	Q5DT21	86 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TMED6	Q8WW62	240 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	NUP50	Q9UKX7	468 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00862	A6NCI5	91 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	NDUFS8	O00217	210 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ARG1	P05089	322 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PRTN3	P24158	256 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SPCS3	P61009	180 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	LMO4	P61968	165 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	KLRD1	Q13241	179 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF266	Q14584	549 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF429	Q86V71	674 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52E5	Q8NH55	327 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	NRGN	Q92686	78 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RPE	Q96AT9	228 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PERP	Q96FX8	193 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CLCC1	Q96S66	551 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	KPTN	Q9Y664	436 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		9.96	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	UPK2	O00526	184 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXH1	O75593	365 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	PLA2G2A	P14555	144 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	MC5R	P33032	325 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	HCP5	Q6MZN7	132 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	COMMD7	Q86VX2	200 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	STPG2	Q8N412	459 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	LHX4	Q969G2	390 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	CXorf58	Q96LI9	332 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4C12	Q96R67	309 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP5S	Q99766	215 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	GINS3	Q9BRX5	216 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	SIRPD	Q9H106	197 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	ARV1	Q9H2C2	271 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	BET1L	Q9NYM9	111 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	PRND	Q9UKY0	176 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	ODF3B	A8MYP8	253 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	VWC2L	B2RUY7	222 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	LY6L	H3BQJ8	138 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO24	O75426	580 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	DFFB	O76075	338 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	KBTBD11	O94819	623 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	LY86	O95711	162 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDLBP-231	ENST00000467435	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms