RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SNAPC3Q92966 411 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SPIN2AQ99865 258 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CSMD3Q7Z407 3707 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV12-3P01733 135 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CSN3P07498 182 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 DEFA5Q01523 94 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 LCN12Q6JVE5 192 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CNIH2Q6PI25 160 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TPRA1Q86W33 373 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N402 240 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 FCGR1BQ92637 280 aa15.98■□□□□ 0.15
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LIMS1-208ENST00000428064 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 LYSTQ99698 3801 aa15.98■□□□□ 0.15
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LIMS1-208ENST00000428064 IGLV2-14P01704 120 aa15.97■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 APELAP0DMC3 54 aa15.97■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 FAM209BQ5JX69 171 aa15.97■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TTC9CQ8N5M4 171 aa15.97■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 OR2K2Q8NGT1 345 aa15.97■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.97■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.97■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 PEMTQ9UBM1 199 aa15.97■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 STARD9Q9P2P6 4700 aa15.96■□□□□ 0.15
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF45Q02386 682 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SPARTQ8N0X7 666 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 LYL1P12980 280 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 OR4S2Q8NH73 311 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 VSTM2AQ8TAG5 236 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.95■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 ATP5G2Q06055 141 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA25Q9BR10 227 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 OR51E2Q9H255 320 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 KBTBD11O94819 623 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 MSMO1Q15800 293 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf55Q5SWW7 151 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 LAX1Q8IWV1 398 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 ISOC1Q96CN7 298 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 SSR3Q9UNL2 185 aa15.93■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 J3QRK9 145 aa15.92■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1G2O95670 118 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 PRH1P02810 166 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 MAS1LP35410 378 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF66Q6ZN08 573 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 OR2A7Q96R45 310 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 PALMDQ9NP74 551 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 HAGHQ16775 308 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 KLK9Q2XQG4 91 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf32Q32M92 178 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 KLK9Q9UKQ9 250 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.91■□□□□ 0.14
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