RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 DEPPQ9NTK1 212 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 HEATR5AQ86XA9 2040 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 ISLRO14498 428 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 DDTP30046 118 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 SELENOTP62341 195 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 RPL8P62917 257 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 FTH1P19P0C7X4 201 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC00869P0C866 280 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 SP9P0CG40 484 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 MFAP2P55001 183 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 RNF151Q2KHN1 245 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM122AQ96E09 287 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB1BQ9H0U4 201 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 BET1LQ9NYM9 111 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 C5orf63A6NC05 138 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 PSG7Q13046 419 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 C17orf98A8MV24 154 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 SSX8Q7RTT4 187 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 OR8I2Q8N0Y5 310 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC35B1P78383 322 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 LEAP2Q969E1 77 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 SPSB4Q96A44 273 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 HSPB9Q9BQS6 159 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 NAGKQ9UJ70 344 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 LNP1A1A4G5 178 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 ICAM4Q14773 271 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 SFXN3Q9BWM7 321 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRN2-201ENST00000389413 GNG7O60262 68 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 OR8B3Q8NGG8 313 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 OR8B2Q96RD0 313 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 DIRC3C9JPN6 131 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 MC5RP33032 325 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 NOTCH4Q99466 2003 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 DLL1O00548 723 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 HYPMO75409 117 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 NEURL1O76050 574 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 CSN3P07498 182 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 APELAP0DMC3 54 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 Q8WTZ3 238 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 EGR1P18146 543 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 C19orf35Q6ZS72 473 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 TRAV24A0A0B4J272 114 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM157AC9JC47 383 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 HOXA5P20719 270 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 NHLH1Q02575 133 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 GAMTQ14353 236 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTCAP3Q53RY4 240 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 GGNQ86UU5 652 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 OR5AL1P0C617 328 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 FCER1GP30273 86 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 RIGQ13278 110 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNRF1Q8ND25 227 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 SFRP2Q96HF1 295 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 CECR9P0C854 216 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 C8orf88P0DMB2 117 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 CCL20P78556 96 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF146Q15072 292 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 MPDZO75970 2070 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 HELZP42694 1942 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 COLCA2A8K830 154 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 HLA-DQA1P01909 254 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 GCHFRP30047 84 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 TFF3Q07654 80 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.62□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 29.1
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM30BQ3MIR4 351 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 RPL39P5Q59GN2 51 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRN2-201ENST00000389413 STPG3Q8N7X2 389 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms