RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 FXYD3Q14802 87 aa12.11□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR4F17Q8NGA8 305 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51H1Q8NH63 302 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TERB2Q8NHR7 220 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4F4Q96R69 305 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP57Q9NU63 452 aa12.11□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 ETV6P41212 452 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 ECI1P42126 302 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 AP3S2P59780 193 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.1□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC190Q86UF4 302 aa12.1□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 FXYD6Q9H0Q3 95 aa12.1□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.09□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 Q8N402 240 aa12.09□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 G3V318 75 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 CFHR3Q02985 330 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PJVKQ0ZLH3 352 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF152Q8N8N0 203 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR4D10Q8NGI6 311 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 R3HDM4Q96D70 268 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC2A9Q9NRM0 540 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDT19A8MXV4 375 aa12.06□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 KBTBD11O94819 623 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF735P0CB33 412 aa12.06□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PPIFP30405 207 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 INPP1P49441 399 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP5CP53041 499 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 RND3P61587 244 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TNXAQ16473 311 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D26Q86UD7 250 aa12.06□□□□□ -0.48
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