RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNIH1O95406 144 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 GP9P14770 177 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPNP16150 400 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 FCGR2CP31995 323 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 RORCP51449 518 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNB1P62873 340 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 FXYD3Q14802 87 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACTBL2Q562R1 376 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR141Q7Z602 305 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 DCUN1D4Q92564 292 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNAPC3Q92966 411 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR5B12Q96R08 314 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 FCGR3BO75015 233 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 APOA1P02647 267 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 AADACP22760 399 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAB9AP51151 201 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDK10Q15131 360 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR107Q5VW38 600 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 AP3S1Q92572 193 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 ISOC1Q96CN7 298 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CMTM3Q96MX0 182 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPYP01298 95 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGLV2-14P01704 120 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CRYGBP07316 175 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD40LGP29965 261 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRSS3P35030 304 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBE2KP61086 200 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 MSMO1Q15800 293 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTF1Q16619 201 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 MZT2AQ6P582 158 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 LFNGQ8NES3 379 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 SOX15O60248 233 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 TEX45Q8NA69 505 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR4S2Q8NH73 311 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 EHFQ9NZC4 300 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALDH3B2P48448 385 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAS2R46P59540 309 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 FXYD4P59646 89 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 HERV-K104P61576 105 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 HPGDSO60760 199 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 TPPP2P59282 170 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNXAQ16473 311 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRSS8Q16651 343 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHB2Q99623 299 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM25AB3EWG3 89 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM25CB3EWG5 89 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM25GB3EWG6 89 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 LINC01619G3V211 115 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ELK1P19419 428 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIR2DS2P43631 304 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 CATR1Q13166 79 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACSM6Q6P461 480 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM17Q86X19 198 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 MFSD4AQ8N468 514 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 BORCS5Q969J3 196 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM68Q96MH6 324 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms