RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	APM4	Q99186	491 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	STE12	P13574	688 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	VPS34	P22543	875 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	PRE4	P30657	266 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	ELF1	P36053	145 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	FDC1	Q03034	503 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	PHO5	P00635	467 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	ORC2	P32833	620 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	MIT1	P40002	666 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	ATG36	P46983	293 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	GPG1	P53130	126 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	YGL081W	P53156	320 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	DOS2	P54858	310 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	HLR1	Q04429	423 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YJR087W	YJR087W	TPK2	P06245	380 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	TMN3	P40071	706 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	SNF12	P53628	566 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.95	□□□□□ -1.78	not detected
YJR087W	YJR087W	DGR2	P32330	852 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YHR033W	P38690	423 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	PIH1	P38768	344 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	PPE1	P38796	400 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	VID28	P40547	921 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	FMP30	Q02883	468 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	HOF1	Q05080	669 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	THI7	Q05998	598 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	AIM41	Q12032	185 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	BRN1	P38170	754 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	FAT1	P38225	669 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.94	□□□□□ -1.78	not detected
YJR087W	YJR087W	FTR1	P40088	404 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	PRM2	P40534	656 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	ULA1	Q12059	462 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	AIM44	Q99299	758 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	STE4	P18851	423 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YEL025C	P39991	1188 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	CPR8	P53728	308 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	MFM1	Q02783	413 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	TRS23	Q03784	219 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	CDC26	P14724	124 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	TUP1	P16649	713 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YMC1	P32331	307 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	CDS1	P38221	457 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	RIM4	P38741	713 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YGL117W	P53133	265 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YCG1	Q06680	1035 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	OSW1	Q08692	278 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	RMP1	Q12530	201 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	MDM10	P18409	493 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	MRPL7	P36519	292 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	YIP4	P53093	235 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	TIM50	Q02776	476 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	SKY1	Q03656	742 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	SEG1	Q04279	960 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.91	□□□□□ -1.78	not detected
YJR087W	YJR087W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YJR087W	YJR087W	HMG2	P12684	1045 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	AEP2	P22136	580 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	CNE1	P27825	502 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	UBP12	P39538	1254 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	ARG7	Q04728	441 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	TGS1	Q12052	315 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	ERG11	P10614	530 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	MTC7	P32633	139 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	LOT5	P34234	306 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	COQ6	P53318	479 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	BUD17	P53727	317 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	RIM13	Q03792	727 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	WHI2	P12611	486 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	HOP1	P20050	605 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YJR087W	YJR087W	AAD3	P25612	363 aa		3.88	□□□□□ -1.79

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