RNA–Protein interactions for RNA: YJL075C

APQ13, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene APQ13, Length 417 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APQ13	YJL075C	AAD3	P25612	363 aa		4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	HOT13	P36078	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	TDA3	P38758	523 aa		4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	HXT7	P39004	570 aa		4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	TMN3	P40071	706 aa		4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	RNH70	P53331	553 aa		4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	SPO1	P53541	631 aa		4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	FDC1	Q03034	503 aa		4.18	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	TUP1	P16649	713 aa		4.17	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	PMA2	P19657	947 aa		4.17	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	NUP1	P20676	1076 aa		4.17	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	MRPL7	P36519	292 aa		4.17	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
APQ13	YJL075C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	FTR1	P40088	404 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	XBP1	P40489	647 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	TAF4	P50105	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	DNM1	P54861	757 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	ECM9	Q02202	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	TIM50	Q02776	476 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	TRS23	Q03784	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	HLR1	Q04429	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
APQ13	YJL075C	MTC7	P32633	139 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	GAT1	P43574	510 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	NET1	P47035	1189 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	YIP4	P53093	235 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	SEC5	P89102	971 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	NSE5	Q03718	556 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	PPN1	Q04119	674 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	CDC26	P14724	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	PTP1	P25044	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	SEC65	P29478	273 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	OAF3	P36023	863 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	FAT1	P38225	669 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	MNN1	P39106	762 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	PRM2	P40534	656 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	BFA1	P47113	574 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	YNL018C	P53976	612 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	HFI1	Q12060	488 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	APM4	Q99186	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
APQ13	YJL075C	CNE1	P27825	502 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	SFP1	P32432	683 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	PPG1	P32838	368 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	PPE1	P38796	400 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	YGR153W	P48238	217 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	YDL183C	P48569	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	FRE7	Q12333	620 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	ADR1	P07248	1323 aa		4.13	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	HOP1	P20050	605 aa		4.12	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	THI6	P41835	540 aa		4.12	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	THI73	Q07904	523 aa		4.12	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	RGT2	Q12300	763 aa		4.12	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
APQ13	YJL075C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	DUN1	P39009	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	COQ6	P53318	479 aa		4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	ARR3	Q06598	404 aa		4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	CIR2	Q08822	631 aa		4.11	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	PIH1	P38768	344 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	VID28	P40547	921 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	GPG1	P53130	126 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	BUD17	P53727	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	MFM1	Q02783	413 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	YPT10	P38146	199 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	EHT1	P38295	451 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	RIM4	P38741	713 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	LRO1	P40345	661 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	USA1	Q03714	838 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	YHM2	Q04013	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APQ13	YJL075C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	HLJ1	P48353	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	GEP3	Q08622	556 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	WHI2	P12611	486 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
APQ13	YJL075C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76

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