RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	PMA2	P19657	947 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	PIP2	P52960	996 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	MET13	P53128	600 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	FDC1	Q03034	503 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYS1	YJL004C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.02	□□□□□ -1.77	not detected
SYS1	YJL004C	STB2	P46679	850 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	TUP1	P16649	713 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	IME1	P21190	360 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	TSR4	P25040	408 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	BEM3	P32873	1128 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	APD1	P38281	316 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	PPE1	P38796	400 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	BUD8	P41698	603 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	ATP23	P53722	227 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	MFM1	Q02783	413 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	HLR1	Q04429	423 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	MRPL9	P31334	269 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	RPC34	P32910	317 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	TDA3	P38758	523 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	TMN3	P40071	706 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	RET2	P43621	546 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	YIP4	P53093	235 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	COQ6	P53318	479 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	YNL193W	P53870	558 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	YPL068C	Q02749	293 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	TFB2	Q02939	513 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	YPS7	Q06325	596 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	CIR2	Q08822	631 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	SWI6	P09959	803 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	MGS1	P40151	587 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	GEP3	Q08622	556 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	WHI2	P12611	486 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	CNE1	P27825	502 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	SNO3	P43544	222 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	NSE5	Q03718	556 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	STP4	Q07351	490 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	PRE4	P30657	266 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	EUG1	P32474	517 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	LOT5	P34234	306 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	MRPL7	P36519	292 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	DUN1	P39009	513 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	NMD5	P46970	1048 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	TAF4	P50105	388 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	YNL018C	P53976	612 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	TGS1	Q12052	315 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
SYS1	YJL004C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	SPC97	P38863	823 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	YJL043W	P47053	257 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	BUD17	P53727	317 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	FRE7	Q12333	620 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	SFP1	P32432	683 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	CKB2	P38930	258 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	YEL025C	P39991	1188 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	FTR1	P40088	404 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	TDA9	Q04545	1251 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.94	□□□□□ -1.78	not detected
SYS1	YJL004C	OPT1	P40897	799 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	IRC8	P47046	822 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	TIM50	Q02776	476 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	AIM41	Q12032	185 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	SSN2	P38931	1420 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	HOP1	P20050	605 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	BRN1	P38170	754 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	PRM2	P40534	656 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	MNT3	P40549	630 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	IES1	P43579	692 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	GSY2	P27472	705 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	JHD1	P40034	492 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	PCI8	P40512	444 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	MEP2	P41948	499 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	YGR153W	P48238	217 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	RSC9	Q03124	581 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	BSP1	Q06604	576 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYS1	YJL004C	SEC65	P29478	273 aa		3.91	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.2 ms