RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YJR039W	P47107	1121 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ABM1	P47146	123 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SMA1	Q02651	245 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SRC1	Q03707	834 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PSY3	Q12318	242 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CKA2	P19454	339 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YEL043W	P32618	956 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GCS1	P35197	352 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YKR018C	P36114	725 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SIP3	P38717	1229 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SAW1	P39735	261 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HDA3	Q06623	655 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.47	□□□□□ -1.85	RIP-Chip
SET1	YHR119W	VHS3	Q08438	674 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	DIN7	Q12086	430 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YDL206W	Q12424	762 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SEN2	P16658	377 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PHO91	P27514	894 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SRP101	P32916	621 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	STB6	P36085	766 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	APM3	P38153	483 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MET18	P40469	1032 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	NAS2	P40555	220 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	THI6	P41835	540 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RSM26	P47141	266 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MON1	P53129	644 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MAK10	Q02197	733 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	DSE3	Q08729	430 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	INO1	P11986	533 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	FAR1	P21268	830 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YCL049C	P25577	312 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MMS4	P38257	691 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	EFM4	P40516	257 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YRB2	P40517	327 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	ASE1	P50275	885 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RPM2	Q02773	1202 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YAP6	Q03935	383 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	ECM18	Q04623	453 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	NDL1	Q06568	189 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	NUR1	Q12066	484 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	HUA2	Q12134	243 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	PRB1	P09232	635 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	SEC15	P22224	910 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	CDC15	P27636	974 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	COT1	P32798	439 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	DAD2	P36162	133 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	ERT1	P38140	529 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	TDA3	P38758	523 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	SOL3	P38858	249 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YDR089W	P38966	869 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MBP1	P39678	833 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YER010C	P40011	234 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	PSF2	P40359	213 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MSH6	Q03834	1242 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	HLR1	Q04429	423 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	BCP1	Q06338	283 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	CLB1	P24868	471 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	KTR2	P33550	425 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.46	□□□□□ -1.86	not detected
SET1	YHR119W	RSM22	P36056	628 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	FET5	P43561	622 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	TOM22	P49334	152 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MUK1	Q02866	612 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	VIK1	Q12045	647 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	SKM1	Q12469	655 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	FLP1	P03870	423 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86

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