RNA–Protein interactions for RNA: YGL137W

SEC27, Transcript of Essential beta'-coat protein of the COPI coatomer, yeast

Gene SEC27, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC27	YGL137W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	DBF20	P32328	564 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	IMA5	P40884	581 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	MNT2	P53059	558 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PEX19	Q07418	342 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ADH4	P10127	382 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PRE4	P30657	266 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	APN2	P38207	520 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YIL092W	P40497	633 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ORC4	P54791	529 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YEL076C	P39971	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	HOS4	P40480	1083 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	BAP3	P41815	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	BIT61	P47041	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	TFC6	Q06339	672 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	RXT3	Q07458	294 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PET127	P32606	800 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	LIP5	P32875	414 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YKL133C	P36066	463 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ECM1	P39715	212 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	SPC72	P39723	622 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ACA1	P39970	489 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	MCM21	Q06675	368 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	SOD2	P00447	233 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	OMA1	P36163	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YBR053C	P38235	358 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	MTL1	P53214	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YNR071C	P53757	342 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PKH1	Q03407	766 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	NUR1	Q12066	484 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	SWM1	Q12379	170 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	TRM11	Q12463	433 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	YBR259W	P38338	688 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	STL1	P39932	569 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	VHS3	Q08438	674 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ECM3	Q99252	613 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
SEC27	YGL137W	BNA1	P47096	177 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	THI22	Q06490	572 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
SEC27	YGL137W	PHO3	P24031	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	MAD3	P47074	515 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	ASK10	P48361	1146 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEC27	YGL137W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	SWD1	P39706	426 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	PEF1	P53238	335 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	PRM2	P40534	656 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	ECL1	P48235	211 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	SPT20	P50875	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	REC102	Q02721	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	ARP7	Q12406	477 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	RAD9	P14737	1309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	FMO1	P38866	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
SEC27	YGL137W	TAF4	P50105	388 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	TEP1	P53916	434 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	MAK10	Q02197	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	ARG1	P22768	420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	YKR075C	P36155	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	FTR1	P40088	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	NSE5	Q03718	556 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	DCG1	P32460	244 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	TGL1	P34163	548 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEC27	YGL137W	FKH2	P41813	862 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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