RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG8	YBL078C	TNA1	P53322	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	HDA1	P53973	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	ARP4	P80428	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	VPS5	Q92331	675 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	NUC1	P08466	329 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	CDC26	P14724	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	DAL5	P15365	543 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MET8	P15807	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	NGG1	P32494	702 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YKR018C	P36114	725 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	DUN1	P39009	513 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	STL1	P39932	569 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	ZIP2	P53061	704 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	TIM10	P87108	93 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MAK10	Q02197	733 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YKU80	Q04437	629 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YCL049C	P25577	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	XRS2	P33301	854 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	STE13	P33894	931 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	TGL1	P34163	548 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	THI80	P35202	319 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SDS22	P36047	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	FLR1	P38124	548 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MUM2	P38236	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SWD1	P39706	426 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PUG1	P40100	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	IMA5	P40884	581 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	IRC5	P43610	853 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SNO2	P53823	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MRPL19	P53875	158 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	ERO1	Q03103	563 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	VID22	Q05934	901 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PSF3	Q12146	194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MTF2	P10849	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	SPO16	P17122	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	PGS1	P25578	521 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	RPD3	P32561	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YKL050C	P35736	922 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	IFA38	P38286	347 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	APE4	P38821	490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	PIK1	P39104	1066 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	HFM1	P51979	1187 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	XYL2	Q07993	356 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	RSB1	Q08417	382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	TRM8	Q12009	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	TAH18	Q12181	623 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	CBP3	P21560	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	PEX5	P35056	612 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YKR075C	P36155	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	POA1	P38218	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YEL076C	P39971	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	PSF2	P40359	213 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	RIC1	P40395	1056 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	RIM8	P53179	542 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	CBK1	P53894	756 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	TAF11	Q04226	346 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	IRC3	Q06683	689 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	PSR1	Q07800	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	ESC8	Q08119	714 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	THI21	Q08975	551 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG8	YBL078C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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