RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	MAP3K5	Q99683	1374 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	DGAT1	O75907	488 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	BMP1	P13497	986 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	POLD1	P28340	1107 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	SEPT3	Q9UH03	358 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	ABL1	P00519	1130 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	PALLD	Q8WX93	1383 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	CEP350	Q5VT06	3117 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	LCE2B	O14633	110 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	AXIN1	O15169	862 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	GPC1	P35052	558 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	SCARF1	Q14162	830 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	PIGB	Q92521	554 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MFSD8-240	ENST00000641658	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	NOS2	P35228	1153 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	POLK	Q9UBT6	870 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	NCAPD2	Q15021	1401 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	TEAD4	Q15561	434 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	RNF217	Q8TC41	542 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	COL26A1	Q96A83	441 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	TTLL8	A6PVC2	850 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	EML1	O00423	815 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	PHKA2	P46019	1235 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	C1QTNF8	P60827	252 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ITPK1	Q13572	414 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	MTMR3	Q13615	1198 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	LAPTM4A	Q15012	233 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SIK1	P57059	783 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	POU4F2	Q12837	409 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	AIDA	Q96BJ3	306 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	PHKG2	P15735	406 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	C4A	P0C0L4	1744 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MFSD8-240	ENST00000641658		H3BRB1	525 aa		7.54	□□□□□ -1.2

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