RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639283.1

AC011416.4-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC011416.4, Length 2,195 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC011416.4-201ENST00000639283 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 CEP135Q66GS9 1140 aa21.48■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 RGS22Q8NE09 1264 aa21.48■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.48■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 FBXW7Q969H0 707 aa21.48■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 ATP2B3Q16720 1220 aa21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 KIF28PB7ZC32 967 aa21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.47■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 MCAMP43121 646 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 GSDMDP57764 484 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 ANO1Q5XXA6 986 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 USP27XA6NNY8 438 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 METTL24Q5JXM2 366 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
AC011416.4-201ENST00000639283 ZNF202O95125 648 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ADD2P35612 726 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 NBPF11Q86T75 865 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 NBPF3Q9H094 633 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ATRNO75882 1429 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.45■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 TRDNQ13061 729 aa21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 BRINP3Q76B58 766 aa21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 KCND1Q9NSA2 647 aa21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ZMYM6O95789 1325 aa21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 CMA1P23946 247 aa21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 PTPN14Q15678 1187 aa21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 NLRP12P59046 1061 aa21.43■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 PFKFB1P16118 471 aa21.43■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 CBX1P83916 185 aa21.43■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.43■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.43■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ZNF592Q92610 1267 aa21.43■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ITGA6P23229 1130 aa21.42■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 SLC39A14Q15043 492 aa21.42■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.42■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.42■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.42■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 SYNE4Q8N205 404 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 CDKL5O76039 1030 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ALG1Q9BT22 464 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 GREM2Q9H772 168 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.41■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 BIN1O00499 593 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 TPM4P67936 248 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 UBE3CQ15386 1083 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 IFNKQ9P0W0 207 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 SMC2O95347 1197 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 NLRP10Q86W26 655 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 TIGD1Q96MW7 591 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 AIFM3Q96NN9 605 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.4■■□□□ 1.02
AC011416.4-201ENST00000639283 STARD3NLO95772 234 aa21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 CTSWP56202 376 aa21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 NCAPHQ15003 741 aa21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 VPS37DQ86XT2 251 aa21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 STRN4Q9NRL3 753 aa21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.39■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 KRT40Q6A162 431 aa21.38■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 APOA5Q6Q788 366 aa21.38■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 FEZ1Q99689 392 aa21.38■■□□□ 1.01
AC011416.4-201ENST00000639283 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms