RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 SNAP23O00161 211 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 RASGRF1Q13972 1273 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 BCORQ6W2J9 1755 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 AIDAQ96BJ3 306 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 ANO6Q4KMQ2 910 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 PLCB2Q00722 1185 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 ALX1Q15699 326 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 BARGINQ6ZT62 677 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 C8orf76Q96K31 380 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 CHD4Q14839 1912 aa27.12■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 ZMYM6O95789 1325 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 MAP3K12Q12852 859 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 MPNDQ8N594 471 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 MAGEB6Q8N7X4 407 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 CPLX1O14810 134 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 CBX8Q9HC52 389 aa27.1■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 MBD4O95243 580 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 LUZP1Q86V48 1076 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 COL4A1P02462 1669 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 NEDD4P46934 1319 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 B4E1Z4 1266 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD4-202ENST00000569223 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.08■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 BCAMP50895 628 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 KCNQ2O43526 872 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.07■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 ME1P48163 572 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 ARMT1Q9H993 441 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CHRNDQ07001 517 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 ENGASEQ8NFI3 743 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 TMEM87BQ96K49 555 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 A0A1B0GUL6 1792 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CASZ1Q86V15 1759 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CTAGE5O15320 804 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 BRAPQ7Z569 592 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 NAPBQ9H115 298 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 APOA5Q6Q788 366 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 FSIP1Q8NA03 581 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 SENP2Q9HC62 589 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 RGS22Q8NE09 1264 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 DNAJC25Q9H1X3 360 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 GJB4Q9NTQ9 266 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 LY9Q9HBG7 655 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 INCENPQ9NQS7 918 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 TPM2P07951 284 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CTDSPL2Q05D32 466 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CLIC4Q9Y696 253 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 KIF28PB7ZC32 967 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 KINO60870 393 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 ZNF165P49910 485 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD4-202ENST00000569223 CDKL5O76039 1030 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD4-202ENST00000569223 CAVIN2O95810 425 aa27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms