RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	HMX2	A2RU54	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	TGFB1	P01137	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP11A1	P05108	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	TCF12	Q99081	682 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ITPKA	P23677	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	GSTM4	Q03013	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	B3GALT4	O96024	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	GRIA4	P48058	902 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	PRR19	A6NJB7	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	SPINK2	P20155	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	USP11	P51784	963 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	POU4F3	Q15319	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	EHD4	Q9H223	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	MED26	O95402	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	DLGAP3	O95886	979 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	IGHA2	P01877	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	RXRB	P28702	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	GPR182	O15218	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	ADH5	P11766	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	MAOB	P27338	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	ORC1	Q13415	861 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	MAP7	Q14244	749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	ARID3A	Q99856	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	BRD1	O95696	1058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	WNT11	O96014	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	DRD2	P14416	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	F13B	P05160	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	C8A	P07357	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	FOSL1	P15407	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-215	ENST00000568227	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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