RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 DYTNA2CJ06 578 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 KLHL33A6NCF5 533 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 KIF5CO60282 957 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC172P0C7W6 258 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 RBP3P10745 1247 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ATP2B1P20020 1258 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ABCD1P33897 745 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 VAC14Q08AM6 782 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 DCTN1Q14203 1278 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 WDR44Q5JSH3 913 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 KANK3Q6NY19 840 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 C16orf87Q6PH81 154 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 LCA5Q86VQ0 697 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CHPFQ8IZ52 775 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC89Q8N998 374 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 XAGE2Q96GT9 111 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 TINF2Q9BSI4 451 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 LZTS1Q9Y250 596 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 E9PCH4 1651 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 PBRM1Q86U86 1689 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ADAMTS12P58397 1594 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ERICH4A6NGS2 130 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 VAMP4O75379 141 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 PDGFRBP09619 1106 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 BCRP11274 1271 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF132P52740 706 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 USP4Q13107 963 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 VPS72Q15906 364 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC93Q567U6 631 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 RELL1Q8IUW5 271 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ARMC5Q96C12 935 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 RUBCNLQ9H714 662 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 PZPP20742 1482 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 TPPPO94811 219 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 THBS1P07996 1170 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF853P0CG23 659 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 LMNB1P20700 586 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ABL2P42684 1182 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 C4orf17Q53FE4 359 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 GNASQ5JWF2 1037 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 RNF135Q8IUD6 432 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ERP27Q96DN0 273 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CDHR1Q96JP9 859 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 POLG2Q9UHN1 485 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ADGRL2O95490 1459 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 KIF16BQ96L93 1317 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ABCC5O15440 1437 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 DNAJC6O75061 913 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms