RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560507.1

ANKRD17-209, Transcript of ankyrin repeat domain 17, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD17, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD17-209ENST00000560507 EDN3P14138 238 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 NFIAQ12857 509 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 IKBKEQ14164 716 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 GJD3Q8N144 294 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 BSNDQ8WZ55 320 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 PMEPA1Q969W9 287 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 FAM161BQ96MY7 647 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 USP26Q9BXU7 913 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 GSC2O15499 205 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 BMP3P12645 472 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 PLCB3Q01970 1234 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 FDX2Q6P4F2 183 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 BCL11AQ9H165 835 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 PARP2Q9UGN5 583 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 USP5P45974 858 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 EHHADHQ08426 723 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 RNF43Q68DV7 783 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 BEND4Q6ZU67 534 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 SLC51AQ86UW1 340 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 TMC1Q8TDI8 760 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 UBXN4Q92575 508 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 CITED4Q96RK1 184 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 DLGAP3O95886 979 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 MAPK8P45983 427 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 ARL4DP49703 201 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 SETDB2Q96T68 719 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 GPR182O15218 404 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 COBLO75128 1261 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 SGO2Q562F6 1265 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 TMC4Q7Z404 712 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 FAM129BQ96TA1 746 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD17-209ENST00000560507 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 DAB2P98082 770 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 PRR19A6NJB7 356 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 ADAMTS4O75173 837 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 TIAF1O95411 115 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 FANCCQ00597 558 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 GSTM4Q03013 218 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 A0A1W2PP55 124 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 MEGF11A6BM72 1044 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 SORBS3O60504 671 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 DRD2P14416 443 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 SPINK2P20155 84 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 GRIA4P48058 902 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 PSMD2Q13200 908 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 MCTP1Q6DN14 999 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 SPATA32Q96LK8 384 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 TCF12Q99081 682 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 TINF2Q9BSI4 451 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 WDR64B1ANS9 1081 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 RXRBP28702 533 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 FGD1P98174 961 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 PCDH1Q08174 1060 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 ORC1Q13415 861 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD17-209ENST00000560507 CCNJLQ8IV13 435 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms